晴朗(lǎng )时节，江户川柯南（高(💪)山南(nán )(🎾) 配(🈴)音）(⛏)和毛利(👃)小五(wǔ )郎（小山力(lì )也 配(pèi )音）、小兰（(🐀)山崎(qí )和佳奈(nài ) 配(🌮)音）以及(jí )少年侦(zhēn )探团的伙伴们(🛎)一同(🚗)来到京都，他们即将登(dēng )(🐨)上自卫(🤷)队的宙(💅)斯盾(dùn )战(zhàn )舰(jiàn )，体验一把(bǎ )出海作战的感(🤔)觉，期间(jiān )还(⏲)结识了(le )美丽(📸)又有(yǒu )着几(jǐ )分(💸)神(🥅)秘的女自(zì )卫队(duì )员(yuán )藤井七海（柴咲幸(xìng ) 配(pèi )音）。谁(shuí )知快(🏓)乐的氛围很快被恐慌(huāng )所替(🚻)代(dài )，战(🐂)舰上(🛃)突然(rán )(👩)发(🧘)现一(🤼)条(❓)断掉的手(shǒu )臂，消(xiāo )失的自(⛴)卫队员又(yòu )引(⏺)起军方的恐慌(huāng )与猜测。原来(🚪)某国神秘间谍X已悄悄(✒)登上宙斯盾(dùn )，伺机盗取战(🐇)舰上的(🔍)绝密(mì )情(qíng )报。
　　为(wéi )了找出隐藏(⤴)的对手，柯(🌻)南和灰原哀(🈹)（林(lín )原惠美 配音）、阿(🌳)笠博士（绪(🔉)方贤一 配音）、服部平次（堀川亮(🕝) 配音）(🚇)以及远山和(😞)叶（宫村(➗)优子 配音）(⤴)通力(lì )合作，与间谍展开连番斗(dòu )智斗(🐩)勇的较量…